Petit, Matthieu Bonhomme baigne dans les albums de la bande dessinée franco-belge (Morris, Peyo, Franquin). Plus tard, il obtient un BTS d'art appliqué et fait la connaissance de Rossi et Mézières qui l'initient à la bande dessinée. En 1999, à l'atelier des Vosges, il rencontre Gwen de Bonneval et Fabien Vehlmann, scénaristes de Messire Guillaume et du Marquis d'Anaon. En 2003 il reçoit le prix Alph-Art du meilleur premier album au festival d'Angoulême pour L'âge de la raison. En 2004, Matthieu Bonhomme crée Esteban pour le magazine Capsule cosmique. La série sera ultérieurement publiée chez Dupuis. Messire Guillaume reçoit le Prix intergénérations au festival d'Angoulême 2010. Il collabore avec Lewis Trondheim pour réaliser Omni-visibilis, puis Texas Cowboys. En 2016, pour les 70 ans du cow-boy créé par Morris, il écrit et dessine un album hommage intitulé L'Homme qui tua Lucky Luke.